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中国2004年至2018年的动物狂犬病监测（2）

Animal Rabies Surveillance, China, 2004–2018

在美国CDC于今年12月出书的专业杂志《Emerg Infect Dis.（新发感染病）》上揭晓了军事医学科学院军事兽医研究所（中国长春）涂长春研究员等的这篇研究论文提供了迄今为止最全面的中国RABV（狂犬病毒）熏染动物的种类、地理漫衍、流传源和遗传多样性的数据集。

中国2004年至2018年的动物狂犬病监测（2）

Animal Rabies Surveillance, China, 2004–2018

在美国CDC于今年12月出书的专业杂志《Emerg Infect Dis.（新发感染病）》上揭晓了军事医学科学院军事兽医研究所（中国长春）涂长春研究员等的这篇研究论文提供了迄今为止最全面的中国RABV（狂犬病毒）熏染动物的种类、地理漫衍、流传源和遗传多样性的数据集。现将该论文的主要内容举行摘译此次公布的是第二部门：

方法狂犬病毒标本收罗、检测

自2004年起中国农业和农村事务部开始实施狂犬病监测计划重点关注流离猫狗特别是有咬人等异常行为的猫狗。

该计划还要求监测家畜和野生动物中疑似发作狂犬病的情况。2004年至2018年共提交了185只疑似患狂犬病动物(死狗、行为异常或咬人的狗、有类似狂犬病临床症状的牲畜、死狐狸、死狼、死貉)的脑组织（见附录表1）。此外,作为主动监测共收集了10,118个脑组织来自三种类型的看似康健的狗,大部门来自狂犬病盛行的农村地域：1.流离和无主的狗、2.用于肉类消费而屠宰的狗,3.在紧迫情况下(在发作狂犬病的疫区为预防进一步流传）杀死的狗。

所有标本由各地域的动物疾病预防和控制中心收集并提交给参考实验室。

脑组织接纳直接荧光抗体测试(FAT)法举行检测使用FITC标志的抗狂犬病单克隆抗体(13)。为获得完整的N基因的编码序列,狂犬病阳性标本的RNA提取使用 TRIzol 试剂盒,随后举行逆转录PCR(6)。

基因测序和系统发生（Phylogenetic）分析

接纳已商业化的Sanger法举行N基因扩增和测序并提交给GenBank(登录号见附录表3)。对从GenBank检索获得的这些序列和其他代表性序列执行完整的N基因系统发生分析,笼罩的样品规模是从1940年月到2018年在中国和周边国家所收集到的(附录表3)。

用MEGA 7法式包来构建系统发生树......。使用Figtree 1.4.2版本(http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtreeExternal Link)对树举行可视化。

为对中国差别RABV系统群（phylogroups）的盛行水平举行排序分析其在中国的流传趋势我们检索了GenBank中所有中国RABV株系的序列。在去除重复序列和没有明确时间信息的序列后我们将剩余的序列与本研究中获得的序列根据前面所述的步骤举行系统分类并按收罗日期举行时间排序。

时空进化分析

上一篇： 被猴子咬伤后需要接种狂犬病疫苗吗？

......基于这些分析对每个RABV分支（clade）的核苷酸取代率和到最近配合祖先的时间(time to most recent common ancestortMRCA)举行了预计。......

效果1. 中国动物狂犬病疫情现状

2004年至2018年从17个省区收集到185只疑似狂犬病动物的脑组织提交本实验室;其中144个样品(77.8%)经FAT检测狂犬病毒阳性(附录表1),在样品为阳性的物种中,狗是主要受熏染动物,占总病例的68.8%(99/144),其次是牛(12.5%)、羊(9.7%)、骆驼(4.2%),狐狸(2.1%)、猪(1.4%)、貉(0.7%)和驴(0.7%)(附录表1)。同时在对来自中国7个省区的康健犬的10,118份脑组织样本的主动监测中发现33份(0.33%)为FAT阳性。

33份阳性标本中31份来自无主的狗(包罗流离狗)2份来自在紧迫情况下所杀的狗(附录表2)。在2013年－2018年陈诉的家畜狂犬病共29个病例包罗牛、羊、骆驼它们来自内蒙古和新疆,都是源于狐狸咬伤(附录表1)。

英文原文：

Feng Y, Wang Y, Xu W, Tu Z, Liu T, Huo M, et al. Animal Rabies Surveillance, China, 2004–2018.Emerg Infect Dis.2020;26(12):2825-2834. https://dx.doi.org/10.3201/eid2612.200303

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中国2004年至2018年的动物狂犬病监测（1）2020-12-07

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